25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0116 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  51.31 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  48.31 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  45.9 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  45.62 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  46.3 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  47.01 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  45.35 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  47.41 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  47.79 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  44.1 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  44.41 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  45.45 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  45.45 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  43.62 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  45.29 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  45.09 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  42.54 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  42.91 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  25 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.69 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  27.23 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>