32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1900 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  73.05 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  73.05 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  68.93 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  66.79 
 
 		 276 aa  361  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  59.72 
 
 		 311 aa  337  9e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  58.3 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  60.22 
 
 		 277 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  53.41 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  54.64 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  52.19 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  45.32 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  44.48 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  45.09 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  44.1 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  47.08 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  40.65 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  39.29 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  37.91 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  38.27 
 
 		 386 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.83 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  27 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  24.58 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  22.99 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.57 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  27.05 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  24.79 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  24.48 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  25.57 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  27.98 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  24.27 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  23.35 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>