32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0576 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  73.05 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  75.71 
 
 
294 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  61.81 
 
 
311 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  64 
 
 
276 aa  341  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  58.51 
 
 
283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  64.36 
 
 
277 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  53.99 
 
 
288 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  52.86 
 
 
272 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  51.81 
 
 
282 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  46.69 
 
 
269 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  45.59 
 
 
269 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  45.45 
 
 
274 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  47.08 
 
 
269 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  46.89 
 
 
272 aa  222  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  41.7 
 
 
273 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  39.01 
 
 
386 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  39.08 
 
 
277 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  38.95 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.25 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  24.73 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  25.9 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  24.72 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.75 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  21.3 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  27.09 
 
 
270 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  29.8 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  24.48 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  23.83 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  27.03 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>