30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3513 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  59.52 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  58.51 
 
 		 280 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  58.51 
 
 		 280 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  58.3 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  60.28 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  55.71 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  55.71 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  49.64 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  48.94 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  49.1 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  46.81 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  46.45 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  44.13 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  43.62 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  44.68 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  41.58 
 
 		 273 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  38.81 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  38.71 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  37.63 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  25.82 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  27.97 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  27.5 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  28.52 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  26.03 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  26.99 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  26.44 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  25.3 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  26.85 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>