46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0223 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  100 
 
 
244 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  28.51 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  28.84 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  29.22 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  28.83 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  26.98 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  29.36 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  28.11 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  27.96 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  29.36 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  27.23 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  27.49 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  27.97 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  32.5 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  28.44 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  30.09 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  27.83 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  26.54 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  28.31 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  27.95 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  28.25 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  28.04 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  28.25 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  26.13 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  25 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  25.75 
 
 
311 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  29.94 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  24.88 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  28.08 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  22.58 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  27.57 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  24.66 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  26.92 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  23.11 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  25.89 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  28.69 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  24.2 
 
 
386 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  25.24 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
279 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  24.19 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  26.28 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  23.83 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
128 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>