138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2446 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  71.32 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  68.18 
 
 		 265 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  65.17 
 
 		 265 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  63.16 
 
 		 265 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  63.91 
 
 		 265 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  63.53 
 
 		 265 aa  348  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  62.5 
 
 		 265 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  61.74 
 
 		 265 aa  337  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  55.47 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  39.85 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  38 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  32.33 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  32.21 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  28.4 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  28.52 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  27.95 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  26.09 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  27.42 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  26.51 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  23.6 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  29.01 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  26.59 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  26.59 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  26.59 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  26.98 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  26.59 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  26.1 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  27.13 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  26.19 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  25.79 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  24.63 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  24.81 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  25.31 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  25.79 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  25.31 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  27.49 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  26.19 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  26.19 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  26.19 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  25.79 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  27.48 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  28.47 
 
 		 326 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  25.2 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  26.19 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  30.91 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  26.09 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  23.69 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  23.53 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  25.6 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  23.29 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  25.79 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  27.1 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  23.72 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  26.19 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  25.2 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  23.11 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  26.57 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.77 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  25.3 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  25.73 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  24.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  26.74 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  26.1 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  30.68 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  23.9 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  25.3 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  24.4 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>