22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0871 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  41.28 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  33.6 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
279 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  29.55 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  27.98 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  26.21 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.4 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  30.61 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.16 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  25.91 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  26.94 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  30.52 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  27.2 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  27.89 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  26.94 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  26.75 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.55 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  32.74 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  22.79 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>