55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  530  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  95.09 
 
 
265 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  62.5 
 
 
271 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  59.47 
 
 
264 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  56.6 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  55.85 
 
 
265 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  56.6 
 
 
265 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  56.23 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  56.23 
 
 
265 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  52.45 
 
 
284 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  40.73 
 
 
271 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  38.38 
 
 
270 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
279 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  31.2 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  29.48 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  30.52 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  29.13 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.44 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  30.71 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  27.5 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  26.56 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  25.2 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  27.2 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  25.9 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  25.45 
 
 
299 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  28.45 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  27.33 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  22.18 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  24.76 
 
 
268 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  24.91 
 
 
326 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  22.36 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 
323 aa  45.4  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  23.86 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  23.68 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  24.7 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 
286 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  22.09 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  25.47 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.1 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  24.1 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  24.19 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  24.02 
 
 
323 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 
286 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 
286 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 
286 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  26.4 
 
 
286 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  24.32 
 
 
289 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>