47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2935 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  56.09 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  43.54 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  40.75 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  42.86 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  42.53 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  42.44 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  41.33 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  39.85 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  38.75 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  38.38 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  38.01 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  29.15 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  30.58 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  26.21 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  25.49 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  27.78 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  25.71 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  26.13 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  23.72 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  23.83 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  25.36 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  23.51 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  26.54 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  24.9 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  25.2 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  26.38 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  25.76 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  34.83 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  22.76 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  24.1 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  24.1 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  24.1 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  23.95 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  24.71 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  22.95 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  23.16 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  25.19 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  24.27 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  20.93 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  23.14 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>