21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0760 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  43.62 
 
 
258 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  36.72 
 
 
260 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  36.12 
 
 
261 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  35 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.52 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  25.49 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  26.72 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  27.69 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  25 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  29.6 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  29.08 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  29.2 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  27.46 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  27.35 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  26.59 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.64 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  27.98 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>