More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32970  transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00742357  hitchhiker  0.0000126002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2803  transcriptional regulator  97.39 
 
 		 307 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3153  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 305 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0123  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2330  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0122  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2307  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2829  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.230533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2256  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0139  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0329  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  38 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1228  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  37.05 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  34.67 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  35.81 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  31.99 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2820  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  36.27 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3137  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.45 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.47 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  33.22 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 367 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 367 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4684  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3085  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4019  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5378  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519344  normal  0.589348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  34.19 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  36.52 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5499  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0853142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>