More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1498 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1498  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.95 
 
 		 429 aa  92  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5050  CinA domain protein  44.14 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0230549  decreased coverage  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  41.13 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  43.24 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  43.27 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  42.99 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  46.6 
 
 		 423 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 422 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 413 aa  74.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  36.97 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  41.9 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  42.31 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 		 425 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 		 425 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  47.92 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.38 
 
 		 406 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 		 424 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 		 424 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 		 424 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  42.72 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  40.16 
 
 		 413 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  36 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.44 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  42.72 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  34.4 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  38.1 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  38.83 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  38.1 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  35.09 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  37.58 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  40.16 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  33.59 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  40.5 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.09 
 
 		 413 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  42.2 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  35.45 
 
 		 415 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  38.6 
 
 		 418 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  38.46 
 
 		 424 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  37.37 
 
 		 416 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  42.31 
 
 		 414 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  43 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  42.31 
 
 		 414 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  45.83 
 
 		 422 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  35.25 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  38.6 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  40.83 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  42.11 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  42.11 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  31.62 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  29.73 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  39.81 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  37.07 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  45.74 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  31.33 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  45.19 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  48.84 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  36.67 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  32.84 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  43.01 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.62 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  46.96 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  37.61 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  35.11 
 
 		 403 aa  65.1  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  34.86 
 
 		 424 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  47.31 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  37.61 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  40 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  44.12 
 
 		 420 aa  64.3  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  36.54 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  42.16 
 
 		 433 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40.21 
 
 		 419 aa  64.3  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  39.42 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  40.78 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  43.01 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  43.3 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  43.88 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  37.61 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  32.98 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  42 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  32.5 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  39.25 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  43.62 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  41.12 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  39.45 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.35 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  40.71 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  35.71 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.7 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  30.89 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>