More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1237 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  100 
 
 		 161 aa  286  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  61.11 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  59.33 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  61.15 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  64.66 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  59.18 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  70.39 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  55.03 
 
 		 433 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  53.9 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  57.24 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  55.48 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  60.58 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  55.56 
 
 		 175 aa  127  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  56.25 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  56.94 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  55.64 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  47.52 
 
 		 411 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  52.31 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  55.78 
 
 		 438 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.83 
 
 		 415 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  48.18 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  60.66 
 
 		 432 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  54 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  46.67 
 
 		 414 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  48.87 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  52.41 
 
 		 218 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  46.53 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  53.49 
 
 		 427 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  43.07 
 
 		 413 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  46.83 
 
 		 416 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  47.79 
 
 		 413 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  42.03 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  46.51 
 
 		 413 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  53.74 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  45.32 
 
 		 186 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.96 
 
 		 413 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  43.38 
 
 		 420 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  47.62 
 
 		 414 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.53 
 
 		 420 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  49.32 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  49.31 
 
 		 420 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  39.1 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  48.34 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  57.25 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.23 
 
 		 408 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  45.64 
 
 		 408 aa  98.2  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.33 
 
 		 203 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.43 
 
 		 415 aa  98.6  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  49.28 
 
 		 162 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  39.69 
 
 		 408 aa  97.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.69 
 
 		 408 aa  97.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 		 412 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  46.09 
 
 		 414 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.36 
 
 		 436 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  40.46 
 
 		 412 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  40.46 
 
 		 412 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  44.6 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  47.76 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  46.03 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  47.76 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  47.76 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  40.16 
 
 		 411 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  47.62 
 
 		 413 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  47.59 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  40.46 
 
 		 412 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  48 
 
 		 413 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  40.46 
 
 		 412 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  40.56 
 
 		 437 aa  95.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  41.36 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  40.46 
 
 		 412 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  40.46 
 
 		 412 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 		 415 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.76 
 
 		 432 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  51.43 
 
 		 410 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  43.75 
 
 		 415 aa  94.4  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  38.64 
 
 		 412 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  41.13 
 
 		 420 aa  94  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  43.87 
 
 		 177 aa  94  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  35.14 
 
 		 364 aa  94  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  41.43 
 
 		 412 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  41.22 
 
 		 415 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 412 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  39.6 
 
 		 371 aa  93.6  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  42.4 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.13 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  39.87 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  41.33 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  39.74 
 
 		 424 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 424 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  43.12 
 
 		 430 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  51.08 
 
 		 408 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  39.49 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  44.76 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.61 
 
 		 424 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 417 aa  91.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  48.94 
 
 		 196 aa  91.7  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  45.89 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  44.88 
 
 		 424 aa  91.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>