More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0281 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  44.71 
 
 		 243 aa  148  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  50.31 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  46.06 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  41.72 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  43.83 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.75 
 
 		 415 aa  95.5  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  42.45 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  41.5 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  41.86 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  37.35 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.09 
 
 		 431 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  42 
 
 		 419 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  42.14 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  41.1 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  39.75 
 
 		 433 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 412 aa  88.6  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 413 aa  88.2  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  44.92 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  38.67 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  33.74 
 
 		 403 aa  87.4  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  42.34 
 
 		 418 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  37.09 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  40.26 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  34.96 
 
 		 275 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.13 
 
 		 436 aa  86.7  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  37.04 
 
 		 415 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  35.93 
 
 		 416 aa  85.1  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  38.16 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  40.82 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  36.97 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0933  competence/damage-inducible protein cinA  39.75 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.329163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  36.94 
 
 		 415 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 416 aa  84.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.86 
 
 		 413 aa  84.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.5 
 
 		 432 aa  84.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  42.03 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  38.85 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  40 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.11 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  38.46 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0005  competence/damage inducible protein CinA  45.87 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  39.24 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.03 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  38.65 
 
 		 438 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  37.58 
 
 		 408 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  39.39 
 
 		 416 aa  81.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  43.84 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  40.14 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  39.71 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 		 412 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  35.93 
 
 		 420 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  33.97 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  35.54 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  38.26 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  39.73 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  37.91 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  36.42 
 
 		 432 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  43.33 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.96 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  35.12 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  34.97 
 
 		 413 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  42.73 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  48.15 
 
 		 423 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  37.41 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  35.1 
 
 		 412 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  35.44 
 
 		 427 aa  78.2  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  39.05 
 
 		 425 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  42.15 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 		 411 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  40.56 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  37.25 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.72 
 
 		 415 aa  77.4  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  34.62 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  40.76 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  36.08 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.14 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  36.2 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  34.76 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  34.13 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  46.79 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0552  hypothetical protein  34.86 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  43.09 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  40.94 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  35.67 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  47.24 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.55 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  34.44 
 
 		 412 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  38.56 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  38.01 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>