More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1097 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  316  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  68.75 
 
 		 167 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  59.86 
 
 		 183 aa  157  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  52.17 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  61.11 
 
 		 433 aa  154  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  65.22 
 
 		 432 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  58.09 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  56.21 
 
 		 438 aa  137  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  53.79 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  53.02 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  53.38 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  51.35 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  51.06 
 
 		 427 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  52.7 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  44.16 
 
 		 413 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  52.63 
 
 		 432 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  51.72 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  48.91 
 
 		 416 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  54.14 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  48.65 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  46.98 
 
 		 411 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  44.79 
 
 		 186 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  48.92 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  38.75 
 
 		 408 aa  117  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  45.27 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  48.68 
 
 		 425 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  42.11 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  45.33 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  48.3 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.37 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  43.26 
 
 		 412 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  60.95 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  50.36 
 
 		 415 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  43.57 
 
 		 412 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  50.34 
 
 		 410 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  40.41 
 
 		 430 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  44.94 
 
 		 419 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  46.67 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  47.22 
 
 		 420 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.71 
 
 		 433 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.41 
 
 		 430 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  48.82 
 
 		 420 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  41.72 
 
 		 423 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  48.59 
 
 		 218 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  48.31 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  40.4 
 
 		 415 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.73 
 
 		 424 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  46.36 
 
 		 418 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  46.76 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  42.68 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  41.43 
 
 		 412 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  43.79 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  42.04 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  45.95 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  45.7 
 
 		 417 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  45.95 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  48.53 
 
 		 420 aa  104  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  41.4 
 
 		 208 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  43.48 
 
 		 411 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  49.63 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  43.65 
 
 		 412 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  45.65 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.45 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  46.31 
 
 		 414 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  40.76 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  45.93 
 
 		 413 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  38.89 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  49.3 
 
 		 419 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  41.55 
 
 		 417 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  42.14 
 
 		 412 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  43.83 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  39.47 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  53.91 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 413 aa  101  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.48 
 
 		 420 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  41.45 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  42.31 
 
 		 436 aa  100  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 408 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  60.36 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  43.62 
 
 		 434 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  43.51 
 
 		 421 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>