More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2175 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 167 aa  322  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  68.75 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  54.32 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  57.93 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  57.24 
 
 		 432 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  56.08 
 
 		 433 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  53.06 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  51.02 
 
 		 411 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  53.02 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  51.33 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  52.38 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  52.94 
 
 		 438 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  48.98 
 
 		 413 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  53.47 
 
 		 203 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  50.69 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  51.02 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  45.1 
 
 		 415 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  51.11 
 
 		 427 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  46.67 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  48.65 
 
 		 413 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  44.44 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  38.96 
 
 		 430 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  43.42 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 413 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  42.66 
 
 		 416 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  44.81 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  53.33 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.59 
 
 		 420 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.31 
 
 		 430 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  45.39 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  45.39 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  45.39 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  45.77 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  49.28 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.38 
 
 		 431 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  40.54 
 
 		 412 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  45.91 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 413 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  45.16 
 
 		 414 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  41.26 
 
 		 415 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  41.48 
 
 		 412 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  40.67 
 
 		 412 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.05 
 
 		 420 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  46.31 
 
 		 218 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 		 412 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  44.29 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  44.22 
 
 		 417 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 412 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 412 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  45.65 
 
 		 436 aa  100  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 412 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  58.2 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 412 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  46.76 
 
 		 434 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  43.71 
 
 		 414 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  45.83 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 425 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  40.6 
 
 		 412 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  43.92 
 
 		 432 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  40.6 
 
 		 412 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  42.41 
 
 		 203 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 411 aa  97.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 408 aa  97.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  42.95 
 
 		 414 aa  97.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.69 
 
 		 424 aa  97.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  46.85 
 
 		 408 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  46.85 
 
 		 408 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  62.28 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  36.65 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40.27 
 
 		 413 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  44.37 
 
 		 421 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  46.09 
 
 		 423 aa  96.7  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  44.37 
 
 		 421 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  46 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  47.18 
 
 		 410 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 417 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  41.06 
 
 		 425 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  44.37 
 
 		 421 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  41.89 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  50.42 
 
 		 408 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 416 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  43.94 
 
 		 418 aa  94.4  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  41.88 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.05 
 
 		 433 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  44.37 
 
 		 419 aa  94.4  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  44.76 
 
 		 422 aa  94  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  40.65 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 415 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 416 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  39.46 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  53.39 
 
 		 181 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  38.73 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  43.05 
 
 		 413 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  38.22 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  45.14 
 
 		 400 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  41.61 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  44.67 
 
 		 420 aa  92  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  42.47 
 
 		 418 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>