More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2809 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  100 
 
 		 181 aa  334  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  61.33 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  58.67 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  59.35 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  54.14 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  58.39 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  61.6 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  55.1 
 
 		 432 aa  131  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  54.35 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  51.33 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  54.17 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  50.34 
 
 		 433 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  49.66 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  61.4 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  61.4 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  61.4 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  62.28 
 
 		 162 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  62.61 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  52.52 
 
 		 427 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  48.34 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  54.1 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  48.65 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  63.16 
 
 		 161 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  47.01 
 
 		 416 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  52.54 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  51.33 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  46.76 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  45.64 
 
 		 437 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  46.99 
 
 		 434 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  49.33 
 
 		 438 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  41.56 
 
 		 414 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  45.83 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 411 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.08 
 
 		 424 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  44.87 
 
 		 408 aa  100  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40.77 
 
 		 413 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.21 
 
 		 420 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  50.7 
 
 		 447 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.62 
 
 		 408 aa  99  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  61.54 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  43.56 
 
 		 167 aa  98.2  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  47.1 
 
 		 218 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  43.33 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  56.14 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  43.71 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 423 aa  96.3  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  46.32 
 
 		 413 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  42.36 
 
 		 436 aa  95.9  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  41.78 
 
 		 415 aa  94.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  45.33 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  42.07 
 
 		 415 aa  94.4  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  40.97 
 
 		 420 aa  94.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  40.69 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  40.69 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  40.91 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  41.67 
 
 		 432 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  39.63 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  39.63 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  40.26 
 
 		 202 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  44.76 
 
 		 429 aa  91.3  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 		 408 aa  91.7  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 		 408 aa  91.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  40.82 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  45.52 
 
 		 162 aa  90.9  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  39.13 
 
 		 414 aa  90.9  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  39.22 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  39.22 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  39.22 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  39.22 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  42.57 
 
 		 425 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  39.13 
 
 		 420 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  41.22 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  40.28 
 
 		 413 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  39.87 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 414 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  39.24 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  41.25 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  35.14 
 
 		 415 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  37.06 
 
 		 412 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  44.97 
 
 		 422 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  44.03 
 
 		 420 aa  89.4  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  40.25 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  38.31 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 413 aa  88.6  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  39.88 
 
 		 421 aa  88.2  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  38.56 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 412 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  42.34 
 
 		 414 aa  88.2  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  45.45 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  38.56 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  46 
 
 		 422 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  49.19 
 
 		 168 aa  87.8  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>