More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1538 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  100 
 
 		 157 aa  289  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  61.74 
 
 		 171 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  57.24 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  53.33 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  72.14 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  57.14 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  54.42 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  58.82 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  52.67 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  54.86 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  52.82 
 
 		 433 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  50.99 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  55.94 
 
 		 203 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  54.01 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  48.87 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  55 
 
 		 438 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  52.38 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  54.23 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  50.35 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  62.61 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  47.52 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  45.45 
 
 		 186 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  57.26 
 
 		 432 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  51.88 
 
 		 427 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  61.72 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 411 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  51.43 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  44.03 
 
 		 414 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  47.59 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  47.59 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  47.59 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.79 
 
 		 416 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.52 
 
 		 432 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  34.67 
 
 		 275 aa  98.6  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  40.79 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.54 
 
 		 415 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40.15 
 
 		 413 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 420 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.46 
 
 		 411 aa  94.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 414 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 406 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  42.47 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  42 
 
 		 173 aa  91.3  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  47.83 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 420 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  43.85 
 
 		 413 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  34.62 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  42.18 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  42.75 
 
 		 412 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  47.73 
 
 		 426 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  45.24 
 
 		 413 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.78 
 
 		 412 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.09 
 
 		 408 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  46.92 
 
 		 434 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  42.24 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  35.62 
 
 		 423 aa  88.2  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  38.24 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.22 
 
 		 414 aa  87.8  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 415 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.04 
 
 		 415 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  40.82 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.22 
 
 		 420 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 		 403 aa  86.3  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  40.67 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  42.86 
 
 		 413 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  40.15 
 
 		 436 aa  85.5  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.34 
 
 		 412 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  44.44 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  33.79 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  52 
 
 		 419 aa  84.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  43.65 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 412 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  36.69 
 
 		 413 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  33.79 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 408 aa  83.6  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.09 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  39.68 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  40.48 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  37.3 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  42.31 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  43.7 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  44.17 
 
 		 419 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  40.94 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  34.53 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  42.2 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  42.28 
 
 		 514 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  37.5 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  38.19 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  37.5 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  36.3 
 
 		 412 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  37.5 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  37.5 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>