More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2456 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  100 
 
 		 166 aa  306  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  60 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  55.35 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  53.15 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  49.35 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  50.66 
 
 		 182 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  55.64 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  49.65 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  54.55 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  43.95 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  47.79 
 
 		 411 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  58.67 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  50.79 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  43.07 
 
 		 411 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  48.3 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  58.27 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  44.9 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  43.92 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  48.91 
 
 		 420 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  42.96 
 
 		 414 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  53.6 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  52.54 
 
 		 432 aa  104  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  45.27 
 
 		 413 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  54.46 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  42.96 
 
 		 420 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  38.36 
 
 		 413 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  43.59 
 
 		 408 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  45.26 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  56.25 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  46.21 
 
 		 433 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 413 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  49.22 
 
 		 427 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.96 
 
 		 416 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  44.22 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.67 
 
 		 371 aa  99.8  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  41.96 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  33.54 
 
 		 412 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.85 
 
 		 415 aa  98.6  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  40.65 
 
 		 424 aa  97.4  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  40.4 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40.58 
 
 		 413 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  37.59 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.14 
 
 		 401 aa  96.3  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  41.91 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  50.83 
 
 		 419 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  39.88 
 
 		 203 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  39.33 
 
 		 415 aa  95.5  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 412 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  48.53 
 
 		 438 aa  94.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  43.88 
 
 		 415 aa  94.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.62 
 
 		 411 aa  94  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  32.91 
 
 		 412 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.76 
 
 		 431 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  40.88 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  40.56 
 
 		 243 aa  92  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  40.15 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  39.6 
 
 		 424 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  41.45 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  42.68 
 
 		 181 aa  91.3  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  40.54 
 
 		 436 aa  90.5  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  34.69 
 
 		 412 aa  90.5  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  34.69 
 
 		 412 aa  90.5  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  40.67 
 
 		 425 aa  90.5  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 		 408 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  30.52 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  40.67 
 
 		 425 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  37.75 
 
 		 423 aa  90.5  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  40.85 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  40.85 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  45.14 
 
 		 421 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 425 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  35.2 
 
 		 416 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  31.37 
 
 		 408 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  40.67 
 
 		 424 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  36.69 
 
 		 413 aa  89  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  40.24 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  42.25 
 
 		 414 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 408 aa  88.2  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  36.77 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 417 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  45.22 
 
 		 218 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 424 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  37.41 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 424 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 424 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  44.44 
 
 		 421 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  42.4 
 
 		 420 aa  87.8  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  44.44 
 
 		 421 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  43.97 
 
 		 416 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 		 408 aa  87.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.96 
 
 		 420 aa  87.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  36 
 
 		 412 aa  87.4  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>