More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1036 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  100 
 
 		 178 aa  357  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  45.51 
 
 		 432 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  45.68 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  48.45 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  47.53 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  45.24 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  49.68 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  44.3 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  50.79 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  44.58 
 
 		 433 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  41.77 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  45.83 
 
 		 411 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  41.18 
 
 		 427 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  45.62 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  53.85 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  42.18 
 
 		 243 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  51.91 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  40.59 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 		 408 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  49.57 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 		 408 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  40.83 
 
 		 413 aa  97.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 		 414 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.4 
 
 		 431 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  45.76 
 
 		 412 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.09 
 
 		 415 aa  96.3  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.49 
 
 		 433 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  43.06 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38 
 
 		 416 aa  95.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.88 
 
 		 424 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  41.43 
 
 		 163 aa  94.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.94 
 
 		 413 aa  94.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  38.41 
 
 		 159 aa  94  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  35.2 
 
 		 275 aa  93.6  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  44.83 
 
 		 438 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  40.41 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  54.7 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  39.72 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  39.29 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  43.44 
 
 		 420 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  41.32 
 
 		 413 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  34.69 
 
 		 415 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  47.27 
 
 		 420 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  38.55 
 
 		 421 aa  91.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 413 aa  91.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  40 
 
 		 162 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  44.35 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 432 aa  90.9  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  42.97 
 
 		 423 aa  90.9  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 		 420 aa  90.5  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  45.31 
 
 		 425 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  38.16 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  39.87 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  36.14 
 
 		 437 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 		 425 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.52 
 
 		 415 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  41.32 
 
 		 420 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  46.09 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  43.29 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  45.74 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  41.32 
 
 		 164 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  41.67 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  36.81 
 
 		 408 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  39.53 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.57 
 
 		 408 aa  87  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.8 
 
 		 429 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  42.98 
 
 		 419 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  41.94 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  38.51 
 
 		 410 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  40.26 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  38.41 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  36.21 
 
 		 436 aa  86.7  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  41.43 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  37.5 
 
 		 408 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  34.59 
 
 		 412 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  38.84 
 
 		 416 aa  85.9  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33.13 
 
 		 419 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  37.2 
 
 		 160 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.98 
 
 		 417 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  45.67 
 
 		 218 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  40.87 
 
 		 415 aa  85.5  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  41.04 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  35.88 
 
 		 424 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  43.9 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf178  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 136 aa  85.1  5e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  39.6 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  36.63 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  39.22 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.77 
 
 		 415 aa  84.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 		 423 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.2 
 
 		 408 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 418 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  31.71 
 
 		 430 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  41.04 
 
 		 166 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  41.04 
 
 		 166 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  39.75 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>