More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0797 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  61.94 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  52.17 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  54.32 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  55.77 
 
 		 432 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  57.24 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  52.29 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  56.25 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  54.05 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  54.01 
 
 		 427 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  50.91 
 
 		 163 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  51.35 
 
 		 433 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  49.34 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  54.72 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  53.96 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  52.7 
 
 		 438 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  51.03 
 
 		 203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  44.74 
 
 		 416 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  43.67 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  47.3 
 
 		 411 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  44.37 
 
 		 415 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  42.47 
 
 		 408 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  43.84 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  51.25 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  53.28 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  48.68 
 
 		 420 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  50.35 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  63.56 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  46.11 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  47.68 
 
 		 413 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  41.06 
 
 		 411 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  47.06 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  47.53 
 
 		 414 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  45.1 
 
 		 413 aa  111  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  45.75 
 
 		 420 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  49.35 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  55.38 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  48.34 
 
 		 413 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  42.57 
 
 		 414 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  46.91 
 
 		 414 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  55.56 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  42.95 
 
 		 413 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  41.78 
 
 		 415 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  40.99 
 
 		 420 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  45.39 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  46.81 
 
 		 437 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  44.06 
 
 		 413 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  52.85 
 
 		 419 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  44.52 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  50.7 
 
 		 410 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  48.95 
 
 		 408 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  47.02 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 		 421 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  47.52 
 
 		 420 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  41.84 
 
 		 364 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 		 421 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  48.95 
 
 		 408 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 		 421 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  42.03 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  43.75 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  43.64 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  48.23 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  49.33 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  43.67 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.83 
 
 		 436 aa  103  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  39.1 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44 
 
 		 432 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  40.41 
 
 		 415 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.31 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.1 
 
 		 408 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  42.24 
 
 		 430 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  44.14 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  47.55 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  40.15 
 
 		 408 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36 
 
 		 424 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.85 
 
 		 412 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  37.97 
 
 		 423 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  36.81 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  41.33 
 
 		 415 aa  101  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  46.48 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  40.6 
 
 		 412 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  41.88 
 
 		 424 aa  100  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.24 
 
 		 430 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  46.76 
 
 		 425 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  46.1 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  38.35 
 
 		 412 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  36.99 
 
 		 401 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  43.95 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.46 
 
 		 431 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  41.1 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  40.52 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.1 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  40.44 
 
 		 411 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  39.63 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>