More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1776 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  100 
 
 		 163 aa  312  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  66 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  55.92 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  54.25 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  53.8 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  53.8 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  56.76 
 
 		 203 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  53.8 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  54.78 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  54.3 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  50.91 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  53.38 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  54.11 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  64.46 
 
 		 181 aa  122  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  48.63 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  50.69 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  48.39 
 
 		 182 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  50.74 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  50 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  51.08 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  50.37 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  44.36 
 
 		 411 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  52.94 
 
 		 438 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  44.44 
 
 		 416 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  44.74 
 
 		 423 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  42.18 
 
 		 415 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  45.86 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  52.63 
 
 		 432 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.55 
 
 		 413 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  38.51 
 
 		 371 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  54.2 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.59 
 
 		 432 aa  104  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  45.74 
 
 		 414 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  45.26 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  49.66 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.24 
 
 		 413 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  53.03 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  53.85 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  40.28 
 
 		 408 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  42.45 
 
 		 415 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.1 
 
 		 415 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  40.13 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  34 
 
 		 412 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  44.44 
 
 		 408 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  45.95 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  42.42 
 
 		 420 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  40.51 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  44.67 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  41.43 
 
 		 178 aa  94.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  94  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  43.06 
 
 		 413 aa  94  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  94  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  94  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  35.37 
 
 		 412 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  35.37 
 
 		 412 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  35.37 
 
 		 412 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  47.45 
 
 		 447 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  38.57 
 
 		 413 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.06 
 
 		 406 aa  91.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  40.58 
 
 		 415 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  45.32 
 
 		 410 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  43.33 
 
 		 196 aa  90.5  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  35.37 
 
 		 412 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.17 
 
 		 431 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 413 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  45.39 
 
 		 434 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  40.13 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  37.74 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.25 
 
 		 415 aa  88.6  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 		 433 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  39.6 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  44.09 
 
 		 425 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  43.75 
 
 		 419 aa  87  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  31.76 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  40.26 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  46.32 
 
 		 408 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 		 411 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  46.32 
 
 		 408 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  37.96 
 
 		 414 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  41.06 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  34.86 
 
 		 420 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  37.32 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  37.16 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0933  competence/damage-inducible protein cinA  30.52 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.329163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  47.76 
 
 		 408 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  41.43 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  34.46 
 
 		 411 aa  85.5  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  41.3 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  42.75 
 
 		 436 aa  84.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  39.31 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  39.31 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.01 
 
 		 408 aa  84  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>