More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1486 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  100 
 
 		 165 aa  306  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  50.64 
 
 		 186 aa  128  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  58.11 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  53.59 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  53.06 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  56.52 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  54.48 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  50.68 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  51.48 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  49.7 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  50.94 
 
 		 438 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  39.49 
 
 		 413 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  58.82 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  47.47 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  48.43 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  48.63 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  48.63 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  51.88 
 
 		 183 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  45.81 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  50.99 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 427 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  51.03 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  58.41 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  45.1 
 
 		 436 aa  99.8  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.82 
 
 		 416 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  45.13 
 
 		 423 aa  99  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  50.96 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  56.48 
 
 		 432 aa  98.2  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  43.62 
 
 		 371 aa  95.5  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  36.25 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  49.66 
 
 		 420 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  37.96 
 
 		 415 aa  94.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 		 411 aa  94.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  41.72 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  40.58 
 
 		 400 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 		 414 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 		 411 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  45.62 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.79 
 
 		 424 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 429 aa  91.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  43.31 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  45.39 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  45.39 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  45.39 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  62.5 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  39.58 
 
 		 415 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  40.27 
 
 		 416 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.56 
 
 		 425 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  46.85 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  48.7 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  40.27 
 
 		 416 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 408 aa  88.2  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  42.48 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.11 
 
 		 411 aa  87.8  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  40.14 
 
 		 413 aa  87.8  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 403 aa  87.8  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 408 aa  87.4  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  45.95 
 
 		 218 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  50.46 
 
 		 423 aa  87  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  34.56 
 
 		 408 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  39.22 
 
 		 432 aa  87  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  43.75 
 
 		 415 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.05 
 
 		 408 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  43.51 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  40.51 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  36.42 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  40.54 
 
 		 412 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  49.54 
 
 		 420 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  40.62 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  43.26 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  41.77 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  32.41 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  39.74 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  39.74 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  39.74 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  49.25 
 
 		 426 aa  84.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  37.76 
 
 		 413 aa  84.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  39.74 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 		 412 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 		 412 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  48.98 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  34.87 
 
 		 412 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  32.45 
 
 		 412 aa  84  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1498  CinA domain-containing protein  43.54 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  42.11 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  42.11 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  42.58 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  39.07 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.95 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  37.84 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  45.69 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 		 412 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  39.88 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  39.84 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.32 
 
 		 431 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  50 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 		 412 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>