More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1356 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  331  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  85.45 
 
 		 175 aa  256  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  55.92 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  51.85 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  56.25 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 433 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  53.89 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  54.61 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  52.63 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  48.65 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  51.02 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  51.77 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  49.36 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  53.28 
 
 		 427 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  63.64 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  48.7 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  51.97 
 
 		 432 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  52.7 
 
 		 438 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  50.72 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  54.47 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  47.68 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  47.68 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  43.79 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  47.68 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  45.45 
 
 		 411 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.68 
 
 		 420 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 416 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  46.36 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  44.68 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.66 
 
 		 413 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.56 
 
 		 433 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.67 
 
 		 424 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  45.52 
 
 		 413 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  45.78 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  54.01 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  41.1 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  46.56 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  45.26 
 
 		 414 aa  97.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  39.18 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  45.26 
 
 		 414 aa  97.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  60.68 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  47.29 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  43.79 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.77 
 
 		 408 aa  96.3  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  42 
 
 		 419 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  44.2 
 
 		 413 aa  96.3  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.42 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  45.33 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  44.94 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  42.96 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  47.48 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.15 
 
 		 420 aa  95.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  39.19 
 
 		 413 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  51.94 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 		 415 aa  94.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 		 408 aa  94  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  39.31 
 
 		 364 aa  94  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  40.38 
 
 		 159 aa  94.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 415 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.33 
 
 		 431 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  39.26 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  41.78 
 
 		 414 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  44.59 
 
 		 425 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  39.26 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  44.53 
 
 		 413 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  39.88 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  39.19 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  39.26 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  39.19 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  39.19 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  39.26 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  39.26 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  39.19 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  46.72 
 
 		 218 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 		 408 aa  92.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.52 
 
 		 432 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 437 aa  92  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  39.01 
 
 		 369 aa  92  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  46.05 
 
 		 410 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  34.03 
 
 		 417 aa  91.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  43.35 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.76 
 
 		 423 aa  91.3  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  37.33 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  39.73 
 
 		 414 aa  90.9  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  42.55 
 
 		 208 aa  90.9  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  40.85 
 
 		 202 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  47.83 
 
 		 447 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  43.54 
 
 		 434 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 		 408 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  36 
 
 		 363 aa  90.5  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  43.17 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  41.55 
 
 		 415 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 		 408 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>