More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1456 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 164 aa  321  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  73.75 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  52.05 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  51.66 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  54.41 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  48.63 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  48.75 
 
 		 408 aa  121  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  50 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  53.68 
 
 		 183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  45.27 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.23 
 
 		 371 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  44.81 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  44.97 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  44.74 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  45.52 
 
 		 414 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  47.06 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  47.18 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  45.16 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.03 
 
 		 416 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  45.7 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  45.58 
 
 		 433 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  41.77 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  44.83 
 
 		 415 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  43.42 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  45.39 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  40.88 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  42.36 
 
 		 420 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.74 
 
 		 412 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  43.4 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  44.72 
 
 		 420 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  39.07 
 
 		 412 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.07 
 
 		 412 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  42.5 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  43.54 
 
 		 432 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  47.22 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  46.85 
 
 		 427 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  38.31 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.31 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  38.31 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  41.21 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.31 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  42.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  48.59 
 
 		 408 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  42.5 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  42.5 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  41.18 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  50.76 
 
 		 408 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.09 
 
 		 412 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  48.32 
 
 		 422 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  42.14 
 
 		 184 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  40.4 
 
 		 415 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.93 
 
 		 436 aa  104  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  42.24 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  39.07 
 
 		 412 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  42.59 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  41.67 
 
 		 417 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  45.07 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  103  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  43.45 
 
 		 413 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  43.23 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  43.54 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  41.51 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  43.67 
 
 		 418 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  38.96 
 
 		 411 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  39.26 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.62 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  43.54 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  39.62 
 
 		 408 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  49.29 
 
 		 438 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  48.76 
 
 		 432 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.41 
 
 		 412 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  41.1 
 
 		 413 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  46.97 
 
 		 420 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  43.06 
 
 		 413 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  40.54 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  45.77 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.73 
 
 		 413 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  49.24 
 
 		 408 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  41.36 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  42.66 
 
 		 423 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  40.56 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  44.37 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  42.22 
 
 		 413 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  40.83 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  38.19 
 
 		 400 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  45.14 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  39.87 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  41.25 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  45.83 
 
 		 430 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  47.37 
 
 		 410 aa  97.1  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>