More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5798 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  100 
 
 		 203 aa  373  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  64.81 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  55.35 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  55.48 
 
 		 175 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  54.37 
 
 		 432 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  50.32 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  50.93 
 
 		 433 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  54.32 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  51.25 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  53.33 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  51.25 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  50.32 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  52.44 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  51.88 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  51.88 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  51.88 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  52.52 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  50.31 
 
 		 438 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.59 
 
 		 431 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  49.68 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  61.6 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  45.22 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  39.01 
 
 		 423 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  48.89 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  49.33 
 
 		 427 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  46.88 
 
 		 421 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.85 
 
 		 413 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  44.85 
 
 		 416 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  43.75 
 
 		 418 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  44.87 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  44.85 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 425 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  56.3 
 
 		 157 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.71 
 
 		 416 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 414 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  54.46 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 410 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  65.71 
 
 		 161 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 408 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  40.99 
 
 		 432 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.88 
 
 		 419 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  49.57 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  38.79 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  42.76 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  46.05 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  37.44 
 
 		 416 aa  99  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  46.5 
 
 		 168 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  49.32 
 
 		 408 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  41.56 
 
 		 413 aa  97.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  49.64 
 
 		 429 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  44.14 
 
 		 164 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  44.83 
 
 		 420 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  40.69 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 414 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  43.14 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.72 
 
 		 408 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  38.31 
 
 		 411 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.72 
 
 		 408 aa  93.2  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  35.75 
 
 		 436 aa  93.6  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  47.9 
 
 		 419 aa  92.8  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  34.76 
 
 		 364 aa  92.4  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 416 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  40.25 
 
 		 420 aa  92  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.1 
 
 		 433 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  38.99 
 
 		 411 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 		 413 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  42.04 
 
 		 415 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.52 
 
 		 424 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  34.25 
 
 		 420 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  34.12 
 
 		 415 aa  89.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  39.74 
 
 		 414 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  36.81 
 
 		 413 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 		 415 aa  89.4  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  44.52 
 
 		 447 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.81 
 
 		 411 aa  89  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  38.46 
 
 		 171 aa  89  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  38.22 
 
 		 414 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  41.45 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  46.99 
 
 		 173 aa  88.2  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  37.58 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  37.58 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  37.58 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  37.58 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  35.44 
 
 		 412 aa  87.8  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  31.06 
 
 		 430 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  36.13 
 
 		 365 aa  87.8  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  47.74 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 412 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  37.75 
 
 		 415 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  32.54 
 
 		 419 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  41.12 
 
 		 434 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  36.94 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.06 
 
 		 430 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 412 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  36.18 
 
 		 172 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.34 
 
 		 412 aa  85.1  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  38.16 
 
 		 431 aa  85.1  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>