More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2324 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 168 aa  328  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  56.08 
 
 		 438 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  54.1 
 
 		 433 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  43.67 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  49.69 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  48.91 
 
 		 427 aa  120  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  48.92 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  55.65 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  50.36 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  52.86 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  48.51 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  46.81 
 
 		 416 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  46.67 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  48.2 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  47.26 
 
 		 413 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  47.86 
 
 		 414 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.05 
 
 		 420 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  44.14 
 
 		 412 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  48.89 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  45.07 
 
 		 432 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  43.12 
 
 		 414 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  41.55 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  46.15 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 		 414 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  42.18 
 
 		 412 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  46.1 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  46.1 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  46.1 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  42.57 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  42.57 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  41.26 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 412 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.77 
 
 		 413 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 400 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  46.21 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  45.86 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  41.56 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  42.41 
 
 		 436 aa  105  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  45.07 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  41.38 
 
 		 411 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 415 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  42.65 
 
 		 411 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 408 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  44 
 
 		 413 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  37.74 
 
 		 423 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  46.83 
 
 		 418 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.22 
 
 		 412 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  38.1 
 
 		 415 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 408 aa  100  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  42.14 
 
 		 414 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  43.57 
 
 		 415 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  46.21 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  42.04 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  49.07 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 420 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  40.82 
 
 		 417 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  41.43 
 
 		 415 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  47.58 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  46.56 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  52.1 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  42.86 
 
 		 437 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  43.14 
 
 		 418 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  43.61 
 
 		 413 aa  97.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 403 aa  96.7  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  44.44 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  42.97 
 
 		 421 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  44.96 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  43.94 
 
 		 415 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 		 412 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  43.97 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  41.45 
 
 		 413 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  45.87 
 
 		 400 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.62 
 
 		 408 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  40.43 
 
 		 411 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  41.51 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  46.45 
 
 		 399 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  38.99 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  36.14 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  42.77 
 
 		 408 aa  95.5  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  43.08 
 
 		 412 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  32.65 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  40.31 
 
 		 364 aa  94.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40.15 
 
 		 419 aa  94.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.37 
 
 		 431 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  43.41 
 
 		 425 aa  94.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  41.22 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl205  competence-damage inducible protein  36.92 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.962311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  40.13 
 
 		 413 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  40.76 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  39.72 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.16 
 
 		 424 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  37.58 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  40.54 
 
 		 416 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.78 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>