More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1022 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  44.71 
 
 		 177 aa  148  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  42.18 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  45.38 
 
 		 170 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  46.56 
 
 		 182 aa  99  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  42.52 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  40.56 
 
 		 166 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  33.8 
 
 		 175 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  33.7 
 
 		 412 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  32.86 
 
 		 415 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  37.67 
 
 		 414 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.61 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  35.92 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  39.26 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  41.32 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  43.8 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  29.07 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  36.67 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  36 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  34.29 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  32 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  34.39 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  40.65 
 
 		 411 aa  79  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  38.66 
 
 		 432 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  41.13 
 
 		 421 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  30.69 
 
 		 425 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  34.32 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.15 
 
 		 413 aa  78.6  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  44.17 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  31.16 
 
 		 167 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  40.83 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  41.18 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  38.66 
 
 		 164 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  39.84 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  38.98 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  30.09 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  34.29 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  38.57 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  37.86 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  32.23 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  33.67 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  40.5 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.31 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  35.77 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.67 
 
 		 411 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  40.16 
 
 		 411 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 		 420 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  37.4 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  39.01 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.57 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  42.98 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  35.38 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  38.46 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  40.56 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  40.29 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  42.15 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  42.5 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  35.46 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  37.78 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  30.27 
 
 		 403 aa  72  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  34.88 
 
 		 415 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  30.77 
 
 		 162 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  37.4 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  36.96 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  40.5 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  43.7 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  37.04 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  38.81 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  40.5 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  32.9 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  37.24 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  31.61 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  32.64 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  37.19 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  38.33 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.23 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  28.04 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  37.19 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  38.33 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  34.17 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  36.84 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  36.23 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  36.84 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  28.84 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  38.33 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  36.13 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  34.01 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  36.5 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  35.04 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  37.59 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>