More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf178 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf178  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  40 
 
 
169 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  39.29 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  41.48 
 
 
420 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  39.29 
 
 
169 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl205  competence-damage inducible protein  45.71 
 
 
152 aa  94  7e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.962311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  38.13 
 
 
175 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  48.15 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.23 
 
 
408 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.58 
 
 
416 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.5 
 
 
408 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  37.78 
 
 
171 aa  87.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  37.5 
 
 
159 aa  87  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  37.06 
 
 
160 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  36.23 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  38.97 
 
 
419 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  40.58 
 
 
414 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 
403 aa  85.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  37.59 
 
 
170 aa  84.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  39.39 
 
 
178 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.37 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  32.86 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  39.06 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  38.52 
 
 
413 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  35.29 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0552  hypothetical protein  33.58 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  38.17 
 
 
415 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  40.29 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 
415 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  38.4 
 
 
420 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  40.65 
 
 
414 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  40.65 
 
 
414 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  40.95 
 
 
413 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  40.68 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.19 
 
 
413 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  34.78 
 
 
415 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.04 
 
 
436 aa  80.5  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  34.33 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  33.79 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 
408 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.12 
 
 
420 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  33.09 
 
 
420 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  38.13 
 
 
400 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  32.62 
 
 
412 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  35.66 
 
 
427 aa  76.6  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.62 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  41.9 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.62 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.29 
 
 
413 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  42.16 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.46 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 
447 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  40.57 
 
 
423 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 
413 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  36.43 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  32.62 
 
 
412 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  35.25 
 
 
275 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.57 
 
 
431 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  38.97 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  34.31 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  37.5 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  34.06 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.81 
 
 
432 aa  73.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  37.41 
 
 
208 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  41.12 
 
 
417 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  41.35 
 
 
423 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  35.61 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  34.78 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  35.97 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  36.96 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  39.02 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  39.25 
 
 
425 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  38.35 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  33.57 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  37.88 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  29.17 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.27 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  38.81 
 
 
166 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  38.81 
 
 
166 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.74 
 
 
433 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  35.97 
 
 
208 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  37.86 
 
 
415 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  31.16 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 
430 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  31.51 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 
437 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  34.56 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  33.57 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  36.23 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  29.66 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  33.58 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  35.33 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  38.24 
 
 
206 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>