More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0552 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  356  9.999999999999999e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl205  competence-damage inducible protein  52.52 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.962311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  32.4 
 
 		 412 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  30.73 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  30.73 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  30.73 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  30.73 
 
 		 412 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  30.17 
 
 		 412 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  30.73 
 
 		 412 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  34.67 
 
 		 416 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  30.17 
 
 		 412 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  29.61 
 
 		 412 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  30.54 
 
 		 412 aa  98.2  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  29.61 
 
 		 412 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  40.94 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  41.13 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  36.71 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.47 
 
 		 415 aa  90.9  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.87 
 
 		 414 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  34.15 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  44.64 
 
 		 415 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.78 
 
 		 408 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 		 408 aa  88.6  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  40.18 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  35.58 
 
 		 403 aa  87.8  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  35 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  37.78 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 		 411 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40.5 
 
 		 413 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  26.92 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  30.5 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  32.48 
 
 		 421 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  35.06 
 
 		 411 aa  85.5  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  30.72 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  36.52 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  27.98 
 
 		 438 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf178  competence/damage-inducible protein CinA  33.57 
 
 		 136 aa  84.3  7e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  31.69 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  28.22 
 
 		 415 aa  84.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  33.1 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  35.21 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  33.85 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  27.81 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.41 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.62 
 
 		 413 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  26.71 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  33.1 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  35.86 
 
 		 412 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  32.86 
 
 		 408 aa  81.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  24.79 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  34.48 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  29.29 
 
 		 399 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  32.85 
 
 		 415 aa  80.9  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  32.76 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  39.34 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  35.86 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  34.51 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.75 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  31.97 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.17 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.96 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  28.95 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  36.36 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0260319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  31.29 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  31.76 
 
 		 418 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  41.35 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  26.24 
 
 		 432 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  29.33 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  38.68 
 
 		 419 aa  79  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  24.38 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  29.86 
 
 		 413 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  29.37 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  31.69 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  33.08 
 
 		 420 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  25.87 
 
 		 412 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  22.58 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  30.14 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  33.33 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  33.33 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  35.71 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  30.5 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  32.89 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  31.69 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  30.97 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  36.15 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  27.67 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  27.27 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  28.57 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  28.21 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  28.17 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.71 
 
 		 420 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 		 423 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  31.69 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  29.17 
 
 		 437 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  31.82 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  27.69 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>