67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3940 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  70.79 
 
 
266 aa  384  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  69.6 
 
 
266 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  41.78 
 
 
292 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  46.19 
 
 
212 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  39.2 
 
 
283 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  41.94 
 
 
418 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  40.65 
 
 
452 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  40.34 
 
 
499 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  42.58 
 
 
516 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  41.18 
 
 
738 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  37.43 
 
 
363 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  41.67 
 
 
447 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  42.76 
 
 
493 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  41.61 
 
 
743 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  41.67 
 
 
465 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  37.36 
 
 
469 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  40.38 
 
 
1050 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  37.58 
 
 
460 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  42.07 
 
 
848 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  41.26 
 
 
346 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  39.86 
 
 
346 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  41.67 
 
 
594 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  39.16 
 
 
343 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  39.16 
 
 
342 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  41.26 
 
 
308 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  35.67 
 
 
465 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  35.76 
 
 
644 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  38.78 
 
 
641 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  31.74 
 
 
340 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  32.53 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  30.21 
 
 
833 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  31.54 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  29.94 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  29.94 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  29.94 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  29.17 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  32.42 
 
 
477 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  32.89 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  31.18 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  28.87 
 
 
792 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  33.74 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  25.93 
 
 
589 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  28.24 
 
 
561 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  34.97 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  35.61 
 
 
1503 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  27.97 
 
 
1462 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  32.75 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  32.89 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  34.06 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  30.14 
 
 
364 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  30.77 
 
 
526 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  31.08 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  30.14 
 
 
352 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  26.57 
 
 
387 aa  62  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  28.67 
 
 
530 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  30.41 
 
 
354 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  28.26 
 
 
950 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  26.9 
 
 
854 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  27.97 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  22.86 
 
 
767 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  26.79 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  24.12 
 
 
1043 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  27.98 
 
 
342 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  40.32 
 
 
190 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  23.78 
 
 
197 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  26.47 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>