172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5071 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 465 aa  893    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  77.21 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  52.08 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  52.15 
 
 		 1050 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  69.85 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  42.22 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  52.6 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  48.98 
 
 		 460 aa  171  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  50.55 
 
 		 848 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  42.29 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  44.15 
 
 		 343 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  44.5 
 
 		 738 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  42.36 
 
 		 308 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  42.25 
 
 		 346 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  42.63 
 
 		 465 aa  143  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  41.48 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  42.62 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  43.48 
 
 		 594 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  41.75 
 
 		 641 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  44.71 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  44.19 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  73.39 
 
 		 380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  34.13 
 
 		 644 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  42.46 
 
 		 363 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  62.66 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  62.66 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  40.98 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  78.63 
 
 		 639 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 		 589 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  76.67 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  81.67 
 
 		 462 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  32.29 
 
 		 833 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 		 792 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 		 561 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  43.15 
 
 		 353 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  38.55 
 
 		 232 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  66.39 
 
 		 606 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  75.21 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  53.7 
 
 		 706 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  63.2 
 
 		 252 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  73.03 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  34.88 
 
 		 266 aa  94.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  34.88 
 
 		 266 aa  94  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  69.42 
 
 		 348 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  42.28 
 
 		 207 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  33.01 
 
 		 220 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  42.28 
 
 		 207 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 813 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  37.64 
 
 		 340 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  32.67 
 
 		 1462 aa  91.3  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  66.39 
 
 		 524 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  76.23 
 
 		 1219 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  67.23 
 
 		 936 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  64.23 
 
 		 326 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  67.77 
 
 		 300 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 469 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  69.09 
 
 		 274 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  35.47 
 
 		 273 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  39.04 
 
 		 292 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  71.54 
 
 		 1055 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  52.83 
 
 		 748 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  33.5 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  71.68 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  32.77 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  33.66 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  71.31 
 
 		 815 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  59.5 
 
 		 712 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  56.8 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  59 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  35.21 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  68.82 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  34.52 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  36.36 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  35.67 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  42.18 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  68.8 
 
 		 300 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  53.46 
 
 		 1168 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  40.91 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  53.23 
 
 		 585 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  39.44 
 
 		 352 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  53.72 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.74 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  62.81 
 
 		 1451 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  37.06 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  35.92 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  32.67 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  33.58 
 
 		 950 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  38.03 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  40 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  59.5 
 
 		 1147 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  45.21 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  35.58 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  71.79 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  77.14 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  74.63 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  74.32 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  35.86 
 
 		 2851 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  33.57 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>