65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0807 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  45.49 
 
 
356 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  44.66 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  49.72 
 
 
319 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  39.64 
 
 
530 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  45.6 
 
 
425 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  35.1 
 
 
351 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  39.9 
 
 
833 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  38.97 
 
 
220 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  38.54 
 
 
1462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  42.19 
 
 
369 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  34.34 
 
 
792 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  41.97 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  41.3 
 
 
589 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  35.75 
 
 
526 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  40.44 
 
 
477 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 
561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  39.18 
 
 
322 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  39.13 
 
 
398 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  38.92 
 
 
207 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  37.09 
 
 
340 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  34.36 
 
 
387 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  38.33 
 
 
207 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  37.93 
 
 
232 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  36.55 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  41.18 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.9 
 
 
950 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  32.96 
 
 
767 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  32.97 
 
 
854 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  31.22 
 
 
1043 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  32.03 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  37.06 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  36.24 
 
 
516 aa  73.6  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  28.51 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  34.81 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  34.03 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  33.76 
 
 
1503 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  33.8 
 
 
1050 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  34.03 
 
 
465 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  29.6 
 
 
738 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  34.52 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  34.39 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  32.82 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  31.47 
 
 
460 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  32.74 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  35.42 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  30.73 
 
 
743 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  30.65 
 
 
499 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  32.93 
 
 
452 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  28.67 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  31.82 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  31.47 
 
 
594 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  31.06 
 
 
493 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  26.06 
 
 
255 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  32.68 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  34.82 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  32.87 
 
 
641 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  26.29 
 
 
266 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  26.29 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  27.98 
 
 
273 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  34.06 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  30.15 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  29.94 
 
 
848 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  29.7 
 
 
197 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  51.52 
 
 
6274 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>