69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0780 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  678    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  42.69 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  34.94 
 
 
1462 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 
792 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  38.22 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  39.9 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  35.33 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 
561 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  32.98 
 
 
833 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  40.13 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 
589 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  28.75 
 
 
322 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  35.9 
 
 
351 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  35.6 
 
 
398 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  39.56 
 
 
342 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  34.3 
 
 
207 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  34.3 
 
 
207 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  30.52 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  32.57 
 
 
346 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  34.98 
 
 
465 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  30.66 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  36.72 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  33.53 
 
 
232 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  32.3 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  34.29 
 
 
526 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  33.66 
 
 
447 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  32.57 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  33.5 
 
 
1043 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  34.01 
 
 
477 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  38.82 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  39.31 
 
 
465 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  31.74 
 
 
418 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  32.21 
 
 
530 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 
854 aa  86.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  30.04 
 
 
364 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  30.66 
 
 
452 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  39.46 
 
 
516 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  31.74 
 
 
273 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  30.69 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  32.7 
 
 
767 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  30.69 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  33.12 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  29.96 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  33.7 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  35.08 
 
 
641 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  30.21 
 
 
743 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  31.72 
 
 
950 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  35.04 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 
848 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  34.72 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  35.17 
 
 
1503 aa  72.8  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  31.79 
 
 
594 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  30.34 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  31.72 
 
 
1050 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  33.54 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  31.97 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  32.34 
 
 
738 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  30.68 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  25.45 
 
 
292 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  30.81 
 
 
255 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2997  hypothetical protein  30.27 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  27.88 
 
 
197 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  26.9 
 
 
644 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  31.22 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  34.01 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1159  hypothetical protein  38.1 
 
 
172 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  32.93 
 
 
190 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>