50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2968 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  386  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  35.85 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  35.85 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  32.04 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  31.91 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  32.73 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  31.71 
 
 		 833 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  29.88 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  29.24 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  30.94 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  34.1 
 
 		 398 aa  72  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  32.34 
 
 		 369 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 767 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  29.95 
 
 		 1043 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  25.28 
 
 		 792 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  31.29 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 854 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  32 
 
 		 950 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  27.69 
 
 		 364 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  32.22 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  31.93 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  27.88 
 
 		 340 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  41.1 
 
 		 1462 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  32.29 
 
 		 425 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  30.67 
 
 		 477 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  28.49 
 
 		 530 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  40.7 
 
 		 465 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  42.05 
 
 		 447 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  30.86 
 
 		 319 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  32.28 
 
 		 352 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  42.05 
 
 		 1503 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  40.96 
 
 		 342 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  43.02 
 
 		 346 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  41.86 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  26.35 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  26.35 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  28.99 
 
 		 338 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1097  hypothetical protein  33.77 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.68714  decreased coverage  0.00547678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  31.68 
 
 		 743 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  23.78 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  36.47 
 
 		 343 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  30.36 
 
 		 526 aa  44.7  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  32.88 
 
 		 465 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  38.16 
 
 		 469 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  32.91 
 
 		 516 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  29.7 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  29.63 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  26.28 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  35.14 
 
 		 452 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  38.27 
 
 		 190 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>