47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1563 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  30.64 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  30.36 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  35.07 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  30.82 
 
 		 319 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1786  hypothetical protein  27.01 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  31.54 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  28.68 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  31.78 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  25.41 
 
 		 792 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  30.08 
 
 		 425 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  29.94 
 
 		 833 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  27.94 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  30.37 
 
 		 352 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  34.82 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  33.66 
 
 		 530 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  32.12 
 
 		 398 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  27.54 
 
 		 561 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  40 
 
 		 1462 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  31.46 
 
 		 292 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  27.16 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  33.71 
 
 		 738 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  33.1 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  28.86 
 
 		 950 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  32.99 
 
 		 1043 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  35.8 
 
 		 338 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  32.95 
 
 		 452 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  24.68 
 
 		 499 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  34.83 
 
 		 356 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  26.43 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  26.43 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 767 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  32.32 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  30.05 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  29.73 
 
 		 447 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  32.67 
 
 		 743 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  29.63 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  34.95 
 
 		 469 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  33.71 
 
 		 516 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  28.41 
 
 		 594 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  32.39 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  30.43 
 
 		 342 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  33.65 
 
 		 848 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>