64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1804 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  683    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  41.32 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  38.69 
 
 		 530 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  38.99 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  35.57 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  31.71 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  39.58 
 
 		 477 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  38.51 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  35.38 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  32.93 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  35.17 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  35.81 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.13 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  30.37 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  38.62 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  32.17 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  32.17 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  32.03 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  31.9 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  31.18 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  35.56 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  32.73 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  34.97 
 
 		 833 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  30.81 
 
 		 792 aa  75.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  33.12 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  30.26 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  35.42 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  29.41 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  34.97 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  31.38 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  34.25 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  35.95 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  30.61 
 
 		 499 aa  69.3  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  32.69 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  34.08 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  32.75 
 
 		 950 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  35.54 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  31.97 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  35.42 
 
 		 266 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 		 1050 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  35.42 
 
 		 266 aa  67  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  32.65 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  33.57 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 		 854 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  35.21 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  31.03 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  34.84 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  31.17 
 
 		 1043 aa  62.8  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  31.94 
 
 		 594 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  34.72 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  28.11 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  32.67 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  29.17 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  32.19 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  33.57 
 
 		 848 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  30.56 
 
 		 1462 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1503 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  28.67 
 
 		 738 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  29.66 
 
 		 465 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  29.86 
 
 		 743 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  28.99 
 
 		 197 aa  46.2  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  35.8 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  26.67 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>