65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1987 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1011    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  45.91 
 
 		 1050 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  44.69 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  46.98 
 
 		 516 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  44.76 
 
 		 738 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  40.26 
 
 		 447 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  38.71 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  39.1 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  37.73 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  39.8 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  45.64 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  33.16 
 
 		 644 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  47.49 
 
 		 848 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  43.32 
 
 		 743 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  41.83 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  40.1 
 
 		 283 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  40.82 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  42.69 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  41.88 
 
 		 343 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  41.21 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  39.9 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  38.12 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  41.71 
 
 		 641 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  42.25 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  40.83 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  39.05 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  39.05 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  39.58 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  34.48 
 
 		 212 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 		 792 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  37.65 
 
 		 353 aa  94  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  36.11 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  38.62 
 
 		 319 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  34.03 
 
 		 833 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  33.55 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  36.23 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  33.73 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  32.47 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  30.77 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  32.65 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  30.56 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  31.79 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  33.1 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  30.34 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  30.41 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  30.61 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  29.86 
 
 		 1462 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  32.18 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  33.57 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  31.25 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 		 1043 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  49.21 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  33.8 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  31.72 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  29.79 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  27.5 
 
 		 950 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.2 
 
 		 767 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  32.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  24.68 
 
 		 230 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  28.66 
 
 		 202 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>