21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1518 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  39.13 
 
 
182 aa  84.7  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6097  hypothetical protein  35.66 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  34.13 
 
 
425 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1776  hypothetical protein  34.11 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  30.28 
 
 
364 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  31.85 
 
 
369 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  32.14 
 
 
353 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  31.82 
 
 
530 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  30.43 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  34.85 
 
 
477 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  32.79 
 
 
332 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  33.83 
 
 
526 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  37.84 
 
 
738 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  29.2 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  29.2 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  31.11 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  28.66 
 
 
499 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1348  hypothetical protein  32.04 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146573  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  25.16 
 
 
356 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  29.63 
 
 
354 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>