68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0953 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  732    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  48.01 
 
 		 353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  41.78 
 
 		 833 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  45.93 
 
 		 207 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  46.86 
 
 		 232 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  45.35 
 
 		 207 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  39.92 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 		 561 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  37.87 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  42.27 
 
 		 220 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  36.47 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 		 589 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  39.59 
 
 		 1462 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 		 792 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  36.79 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  41.67 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  36.32 
 
 		 530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  35.08 
 
 		 477 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  36.54 
 
 		 950 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  34.8 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  33.72 
 
 		 767 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  33.92 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  30.28 
 
 		 526 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  35.68 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 1043 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  37.33 
 
 		 308 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  35.75 
 
 		 425 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  38.89 
 
 		 516 aa  92.8  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  41.78 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  36.99 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  33.15 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  34.08 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  30.04 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  33.12 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  33.92 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  37.67 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  34.64 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  34.97 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  35.86 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  35.81 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  42.18 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  35.57 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  34.72 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  34.25 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  39.04 
 
 		 1050 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  38.36 
 
 		 848 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  29.59 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  34.27 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  32.26 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  32.65 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  32.26 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  31.07 
 
 		 743 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  33.56 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  29.81 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  32.35 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  29.81 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  30.14 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  31.47 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1503 aa  62.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  27.69 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  27.95 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  32.86 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  31.65 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  27.32 
 
 		 738 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  30.28 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  40.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>