22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1025 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  39.13 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6097  hypothetical protein  29.23 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  32.86 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1776  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  36.17 
 
 		 369 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  30.43 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 		 561 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  37.11 
 
 		 530 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  30.39 
 
 		 792 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  29.29 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  31.62 
 
 		 833 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  26.52 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  27.35 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1786  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  35.63 
 
 		 526 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  26.56 
 
 		 425 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  27.41 
 
 		 319 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  26.5 
 
 		 332 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>