52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1283 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  47.02 
 
 
308 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  37.5 
 
 
343 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  68.85 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  63.93 
 
 
346 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  62.3 
 
 
346 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  59.02 
 
 
447 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  60 
 
 
641 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  65.22 
 
 
465 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  53.23 
 
 
363 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  49.21 
 
 
499 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  62 
 
 
452 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  45.21 
 
 
418 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  56.25 
 
 
493 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  56.36 
 
 
516 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  47.62 
 
 
460 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  50.77 
 
 
469 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  51.85 
 
 
1050 aa  58.9  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  49.02 
 
 
1043 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  58.7 
 
 
848 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  47.14 
 
 
1503 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 
743 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  61.7 
 
 
594 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  50.88 
 
 
319 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  56 
 
 
425 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  51.02 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  45 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  42.62 
 
 
833 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  45 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  45.9 
 
 
767 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  48.89 
 
 
792 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  40.32 
 
 
364 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  47.17 
 
 
351 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  44.93 
 
 
530 aa  48.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  60 
 
 
854 aa  48.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 
589 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  38.71 
 
 
292 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  40.32 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  36.51 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  44.26 
 
 
1462 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
561 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  44.07 
 
 
526 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  47.83 
 
 
465 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.44 
 
 
950 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  46 
 
 
353 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  32.93 
 
 
340 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  53.85 
 
 
283 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  40.68 
 
 
352 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  44.19 
 
 
354 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  41.51 
 
 
342 aa  41.6  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  42.55 
 
 
220 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  35.94 
 
 
266 aa  41.2  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>