33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2477 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  36.67 
 
 		 447 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  36.67 
 
 		 465 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  36.44 
 
 		 398 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  30.47 
 
 		 792 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  31.78 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  34.04 
 
 		 352 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  34.85 
 
 		 460 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  32.59 
 
 		 499 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  35.85 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  35.85 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  31.79 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  35.85 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  29.79 
 
 		 387 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  34.23 
 
 		 833 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  36.89 
 
 		 469 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  34.35 
 
 		 465 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  38.83 
 
 		 848 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  33.55 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  28.68 
 
 		 452 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  31.5 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  31.43 
 
 		 319 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  30.07 
 
 		 364 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  29.69 
 
 		 369 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  42.03 
 
 		 561 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  30.08 
 
 		 418 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  38.27 
 
 		 197 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  31.4 
 
 		 346 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  33.73 
 
 		 1462 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>