36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0352 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  686    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  37.12 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  30.34 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2997  hypothetical protein  34.97 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  34.42 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  32.57 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  30.34 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  28.37 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  31.65 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  28.97 
 
 		 526 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  27.97 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  28.32 
 
 		 1462 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  28.86 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  30.22 
 
 		 833 aa  53.1  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  31.29 
 
 		 589 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  29.17 
 
 		 792 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  27.27 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1503 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  34.01 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  34.27 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  31.11 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  29.41 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  32.12 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  26.09 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  29.28 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  28.21 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  30.15 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  27.17 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  26.47 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  29.63 
 
 		 447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  29.08 
 
 		 594 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>