13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2997 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  729    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  34.97 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  30.63 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  31.87 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  30.27 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  32.04 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  29.85 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  28.48 
 
 		 1462 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  28.38 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  36.67 
 
 		 526 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  26.92 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  27.03 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  26.76 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>