205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4874 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4874  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 598 aa  1196    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0766872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3003  glycoside hydrolase 15-related  69.36 
 
 		 602 aa  762    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  41.47 
 
 		 586 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  39.6 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  38.22 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  39.74 
 
 		 619 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  38.59 
 
 		 627 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  38.7 
 
 		 597 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  39.27 
 
 		 601 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  39.17 
 
 		 598 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  40 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  39.24 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  40.43 
 
 		 598 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  39.06 
 
 		 613 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  37.83 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  40.07 
 
 		 602 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  38.98 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  40.37 
 
 		 600 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  38.97 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  40.13 
 
 		 617 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  37.23 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  38.13 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  36.93 
 
 		 625 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  38.69 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.46 
 
 		 617 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  39.64 
 
 		 621 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  37.91 
 
 		 602 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  37.85 
 
 		 627 aa  364  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  38.96 
 
 		 609 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  37.29 
 
 		 608 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  37.75 
 
 		 602 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  37.88 
 
 		 605 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  39.17 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 		 602 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  38.06 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  37.98 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  38.46 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  39.73 
 
 		 589 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 605 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  37.69 
 
 		 626 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  37.58 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  37.58 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  37.25 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  37.58 
 
 		 609 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  39.07 
 
 		 665 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  37.52 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 		 609 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  37.73 
 
 		 620 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  36.92 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  34.67 
 
 		 612 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  37.58 
 
 		 626 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  36.78 
 
 		 598 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  36.96 
 
 		 619 aa  350  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  36.67 
 
 		 629 aa  349  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 		 613 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  36.79 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  36.48 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  37.46 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  36.95 
 
 		 626 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  35.34 
 
 		 593 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  36.76 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  37.63 
 
 		 599 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  36.54 
 
 		 614 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  36.48 
 
 		 612 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  36.9 
 
 		 600 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  35.49 
 
 		 597 aa  339  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  36.42 
 
 		 601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.19 
 
 		 601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  37.39 
 
 		 611 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  37.38 
 
 		 603 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  37.46 
 
 		 605 aa  336  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  37.67 
 
 		 616 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  36.27 
 
 		 636 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  36.26 
 
 		 629 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  34.55 
 
 		 612 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 608 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  36.53 
 
 		 596 aa  331  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  35.95 
 
 		 592 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  37.1 
 
 		 599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  34.87 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  38.24 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  36.12 
 
 		 635 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  35.69 
 
 		 645 aa  326  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  36.14 
 
 		 672 aa  326  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  36.7 
 
 		 599 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  34.74 
 
 		 639 aa  325  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  36.97 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  35.53 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  35.45 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  35.93 
 
 		 668 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  35.32 
 
 		 608 aa  323  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  35.97 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  35.48 
 
 		 677 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>