More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4081 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4081  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  603  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2755  hypothetical protein  30.34 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0392069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 267 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  30.38 
 
 		 556 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.75 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  23.98 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.92 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  23.27 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.01 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.83 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.58 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.21 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  26.22 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  31.3 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.42 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.01 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  32.58 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.78 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  31.58 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.82 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  33.65 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0276  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267847  normal  0.743804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.06 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  33.98 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  26.1 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  30.19 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  28.02 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.11 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.16 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.53 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2766  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.07 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>