More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2755 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2755  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  568  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0392069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4081  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.62 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2766  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  32.62 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  28.93 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  36.61 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  25.5 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.1 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.25 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  29.09 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  28.1 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.29 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  27.78 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  26.43 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  27.37 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  29.31 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 335 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.53 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 350 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.2 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.75 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  32.73 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  33.71 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.2 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  29.2 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.37 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>