51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1225 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 297 aa  577  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  41.5 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  41.61 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  41.61 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  36.28 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  33.23 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  40.88 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  38.93 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  37.26 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  34.51 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  36.77 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.01 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  27.56 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.24 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.32 
 
 		 426 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.95 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.68 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  27.91 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  24.22 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  21.3 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>