40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8205 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  100 
 
 		 304 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  54.02 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  54.3 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  46.77 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  38.64 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  38 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  42.79 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  38.49 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  35.02 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  37.05 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  36.94 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  36.03 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  36.28 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  32.16 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  27.98 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.71 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  25.08 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  25.31 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.29 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>